gtex

1. 同一个变异在不同组织都存在 但不同效应 ->可以解释两个性状负相关机制
2. 同一个变异对整体的影响

sQTL影响可变剪切丰富度

missing regulation –developmental GTEx

遗传变异丰富
Farm GTEx意义：
找到与真正casual variant最相近的snp，提升芯片预测准确度。
物种间的借鉴意义
组织间的借鉴意义

在不同组织共定位的意义

rnaseq 填充可以解决cis QTL问题 不能解决trans eQTL问题
MBRA 功能变异验证
遗传力富集区域
怎么知道是甲基化了影响 介导

杨树 松树 注释转录调控区域
不同种群 荟萃分析

参考单倍型图谱，群体水平上 rnaseq reference: UTR
encode计划：功能注释 同一生态型不同时期；ATACseq hi-c
800个转录因子的atacseq
做一个生态型
gtex：独立生态型 IBS 同一个体筛掉SNPcall

不同环境 可塑性怎么遗传

标签转移
https://github.com/fjchange/Papers-Notes/blob/master/LPA（标签转移算法）.md
数据点相近具有相似的标签

原位atac-seq
空间组学

color space

表达可塑性